Fusão ocorre quando duas ou mais empresas são combinadas e a empresa resultante mantém a identidade de uma delas, já a aquisição ocorre com a compra de um número suficiente de participações de ações e a empresa adquirida é tratada como um investimento pela empresa adquirente. Fonte: http://www.artigos.com/artigos/administracao/fusoes-e-aquisicoes-1623/artigo/